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| 高通量 16S rRNA 标签测序法比较人与不同动物肠道微生物组多样性 |
| 邓冠华 1, 查龙应 2, 张国霞 2, 王玉 3, 黎耀涛 2, 彭欣 2, 周宏伟 2,*, 刘移民 1,* |
1. 广州市职业病防治院职业卫生评价检测中心, 广州市医学重点学科职业健康监护科, 广州市职业环境与健康效应实验室,广州 510620
2. 南方医科大学公共卫生与热带医学学院, 广州 510515
3. 内蒙古自治区赤峰市疾病预防控制中心, 内蒙古赤峰 024000 |
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摘要 收集人、大猪、小猪、大鼠、小鼠以及鸡五个不同个体的粪便样品 , 每个个体取两个平行样 , 提取总 DNA;PCR 扩增 , 获得 16S rRNA V6 标签片段 ; Illumina 测序 ; 经 BIPES 以及 QIIME 分析并比较菌群结构及多样性。研究结果发现 , 不同物种之间肠道菌群差异较大。五类物种肠道菌群均以厚壁菌门、拟杆菌门、以及变形菌门为主 , 但鸡的厚壁菌门显著减少 , 而变形菌门显著增加。从α多样性角度来看 , 猪肠道菌群种属丰富度及 Shannon 指数均显著高于人及鸡肠道菌群。从β多样性角度 , 尽管不同人之间的肠道菌群相似度较低 , 但不同物种之间相比较 , 小猪与大鼠肠道菌群与人相似性高于小鼠和鸡肠道菌群。与人类相比 , 小猪的肠道微生物组最相近 , 而鸡的肠道菌群相似度最低。
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| 引用本文: |
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邓冠华 1, 查龙应 2, 张国霞 2, 王玉 3, 黎耀涛 2, 彭欣 2, 周宏伟 2,*, 刘移民 1,*. 高通量 16S rRNA 标签测序法比较人与不同动物肠道微生物组多样性[J]. 生态科学, 2014, 33(5): 851-857.
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| 链接本文: |
| http://www.ecolsci.com/CN/Y2014/V33/I5/851 |
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