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| 核糖体小亚基V4和V9区引物扩增大亚湾真核浮游生物的比较研究 |
| 郭雨沛1,2, 黄良民1,2, 钟瑜1, 陈靖夫1,2, 谭烨辉1,2, 陈绵润3, 邱大俊1,2,* |
1. 中国科学院南海海洋研究所, 中科院热带生物资源与生态重点实验室, 广州 510301
2. 中国科学院大学, 北京 101408 |
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摘要 对大亚湾水体的环境DNA分别进行18S rDNA的V4和V9区的引物扩增, 通过高通量测序技术进行测序, 并比较分析二者浮游真核生物基因多样性和相对丰度。18S rDNA V4区引物扩增共检测出浮游动物56 纲, 101 目, 浮游植物52 纲, 69 目; 18S rDNA V9区引物扩增共检测出浮游动物47 纲, 81目, 浮游植物56 纲, 101 目。两对引物对浮游真核生物扩增都具有较高覆盖度, 在纲级别上二者的结果相近: 颚足纲(Maxillopoda)是浮游动物优势类群; 甲藻纲(Dinophyceae)、圆筛藻纲(Coscinodiscophyceae)、小豆藻纲(Mamiellophyceae)是浮游植物优势类群, 其中甲藻纲多样性与丰度的结果相近, 而18S rDNA V9区引物扩增得到的圆筛藻纲丰度高于18S rDNA V4区引物。分析结果表明, 18S rDNA V4区引物扩增的浮游动物多样性比18S rDNA V9区引物高, 而18S rDNA V9区引物扩增的浮游植物多样性比18S rDNA V4区引物高。同时, 通过高通量测序技术首次确定大亚湾海区大量存在着寄生型甲藻(Syndiniales), 小豆藻目(Mamiellales)。
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| 引用本文: |
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郭雨沛1,2, 黄良民1,2, 钟瑜1, 陈靖夫1,2, 谭烨辉1,2, 陈绵润3, 邱大俊1,2,*. 核糖体小亚基V4和V9区引物扩增大亚湾真核浮游生物的比较研究[J]. 生态科学, 2023, 42(1): 242-.
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| 链接本文: |
| http://www.ecolsci.com/CN/Y2023/V42/I1/242 |
| [1] |
邰继承, 李锐, 杨恒山, 马金慧, 萨如拉. 不同灌溉措施下春玉米田间N2O和CO2日变化特征及影响因素研究[J]. 生态科学, 2023, 42(2): 1-. |
| [2] |
邓小红, 王健健*. 模拟大气CO2浓度升高对虎耳草生理特性和药用品质的影响[J]. 生态科学, 2023, 42(2): 9-. |
| [3] |
马永霞, 贺玉晓, 郑永坤, 张志纯, 李卫国*, 赵同谦. 丹江口水库一株硅藻的分子鉴定及氮素对其生长的影响[J]. 生态科学, 2023, 42(2): 17-. |
| [4] |
张亚丽1,2, 胡希军1,*, 尹伟特3, 杨贤均2, 李晓红2, 邢肖毅2 . 环长株潭次级城市群生态足迹变化与经济脱钩研究[J]. 生态科学, 2023, 42(2): 26-. |
| [5] |
谭芷晴1,2, 桂林1, 李新昌2，王小兰1,*. 炔诺酮暴露下斑马鱼候选生物标志物筛选研究[J]. 生态科学, 2023, 42(2): 35-. |
| [6] |
佟金鹤1,2,*, 张卫红3, 刘少军1,2, 李伟光2,4, 陈小敏2,4. 中国橡胶树大风、寒害的时空分布分析[J]. 生态科学, 2023, 42(2): 43-. |
| [7] |
李阳1, 2, *, 丁芳兵1, 王宏1, 张蕾1, 李仁娜1, 闫会玲1, 魏莹1, 李倩1. 无患子落叶浸提液对四种委陵菜种子萌发和幼苗生长的影响[J]. 生态科学, 2023, 42(2): 47-. |
| [8] |
沈若兰1,2,3, 肖桂荣1,2,3,*. 武夷山国家公园生态系统服务价值评估[J]. 生态科学, 2023, 42(2): 58-. |
| [9] |
周宇, 赵美玉, 齐开, 赵丽娅*. 基于土地利用的神农架生态资产价值研究[J]. 生态科学, 2023, 42(2): 66-. |
| [10] |
李键1, 毛德华2,*, 胡兵1, 陈伟1, 陈炉1, 周健1. 生态文明理念下长沙市自然生态空间用途管制探索[J]. 生态科学, 2023, 42(2): 74-. |
| [11] |
任文春2, 刘海鸥1, 黄俊桦2, 车赛男2, 杜乐山1, 3, *. 基于条件价值法(CVM)的西黑冠长臂猿非使用价值评估[J]. 生态科学, 2023, 42(2): 84-. |
| [12] |
杜瑞鹏1, 许玥2，张志东1, *. 海南霸王岭林区人为干扰风险评价[J]. 生态科学, 2023, 42(2): 92-. |
| [13] |
严军*, 陈晨. 基于多生态安全格局的生态保护红线划定方法研究[J]. 生态科学, 2023, 42(2): 100-. |
| [14] |
廖艳梅1,3, 尹林江2, 兰安军3,4,*, 翟香3, 施厚军3, 张玉彪3, 钟九生3,4. 黔西北贫困山区不同地貌形态下土地利用变化的地形梯度效应分析[J]. 生态科学, 2023, 42(2): 111-. |
| [15] |
涂志华1,2,3, 周凌峰1,2,3, 黄艳萍1, 张幸幸1, 章陈菲1, 李紫叶1, 韩琳1, 郭雅欣1, 陈夙怡1, 陈金辉1,2,3, 李胜男4,*. 海南黎母山热带云雾林3种优势树种根际土壤微生物量季节动态及根际效应[J]. 生态科学, 2023, 42(2): 119-. |
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