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| 禽类特异性引物在珠江三角洲地区的适用性研究 |
1. 武汉理工大学资源与环境工程学院, 武汉 430070
2. 环境保护部华南环境科学研究所, 广州 510655
3. 武汉科技大学资源与环境工程学院, 武汉 430081
4. 华南理工大学生物科学与工程学院, 广州 510006
5. 广东省水与大气污染防治重点实验室, 广州 510655 |
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摘要 以珠江三角洲地区为目标研究区域, 采集不同地区猪、牛、人、狗、鸽、羊及家禽等72 份粪便样品, 进行DNA 提取, 并选取8 种针对鸡肠道内优势菌群而开发出的特异性引物进行地区适用性验证。结果表明: 粪便DNA 提取试剂盒提取的DNA 纯度符合后续PCR 扩增实验要求。Faecalibaterium 通用引物FAU-F/FAU-R(1#)检出率为87%(63/72), 对禽类、反刍动物及哺乳动物等都具有较好地检出效果。鸡的特异性Faecalibaterium 引物Fach-F1/Fach-R1、Fach-F2/Fach-R2(2#、3#)、特异性短杆菌引物LA35F/LA35R(4#)、特异性拟杆菌引物chBact-F1/chBact-R16、CP2-9F/CP2-9R(5#、7#)灵敏度较差; 鸡的拟杆菌特异性引物qC160F-HU/qBac265R-H(6#)、鸡的梭状芽胞杆菌特异性引物CP3-49F/CP3-49R(8#)特异性较差, 在珠江三角洲地区都不具备较好的适用性。然而, 当源解析的目标由鸡扩大至禽类, 6#及8#引物的特异性分别提高至81%和72%, 满足珠三角地区禽类粪便污染源解析的适用条件。
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| 关键词 ：
微生物污染源解析,
灵敏度,
特异性,
珠江三角洲地区
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